设备分类编码: 019900

仪器设备分类: 专用

主要学科领域: [水产学]

仪器设备来源: 购置

联系电话: 010-68697561

电子邮箱: xuj@cafs.ac.cn

通讯地址: 北京市丰台区青塔西路150号，南楼212

邮政编码: 100141

联系人: 许建

仪器所属类别: 分析仪器>>其他>>其他

规格型号: ION TORRENT

所属科研设施:

主要功能: 未知基因组序列的全新测序，已知基因组序列的再测序，mRNA测序分析，染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）研究,转录组测序，表达谱分析，目标片段测序，二代平台的文库质量控制，扩增子测序，拷贝数分析，甲基化，双端测序等。

主要技术指标: 1、通量：有三种通量的测序芯片灵活可选，分别是10Mb、100Mb、1Gb，适合不同通量需求的应用 2、测序原理要求：系统无需激发光源，无需荧光标记，无需照相系统直接实时检测测序时产生的氢离子浓度。 3、使用半导体测序芯片，不小于120万个反应微孔。 4、运行速度：每轮反应约4小时可以得到平均读长为200bp的1G的测序通量 5、读长：单端检测序列不少于200bp，可升级到400bp。可进行Matepair和Pairend测序。 6*、读取精度：原始数据准确性≥99.5％，一致序列准确性≥99.99% 3.7、配备定制服务器： 预装主机操作软件 芯片：双路六核处理器 内存：≥48GB 储存：≥8个2TB硬盘构成的RAID5阵列（12TB可用容量）配套的服务器可以支持上千个RUN的数据存储 3.8、网络：四端口前兆网卡 3.9*、软件：预装与定制服务器之上，要求包括： Ubuntu operating系统软件、 PostgreSQL数据库软件、 Apache网络服务软件、 PHP网络脚本语言软件、 Python编程语言软件、 Sun GridEngine软件。

安放地址: 北京市丰台区青塔西路150号，1号楼201

服务内容: 以转录组测序和RAD测序为主

服务的典型成果: 无

对外开放共享规定: 在管理部门批准的情况下，以横向服务方式进行开放。

参考收费标准: 1.8万元/反应