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分子设计研究系统  (收藏)

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设备分类编码: 099900

仪器设备分类: 专用

主要学科领域: [基础医学, 药学, 中医学与中药学]

仪器设备来源: 购置

联系电话: 010-84738620

电子邮箱: collean_zhang@163.com

通讯地址: 望京中环南路6号

邮政编码: 100102

联系人: 张燕玲

仪器所属类别: 医学科研仪器>>其他>>其他

规格型号: SYBYL6.5

所属科研设施:

主要功能: SYBYL提供基于配体的设计方法,包括构效关系建模,药效团生成以及分子叠合等关键的基于配体的设计任务。同时,SYBYL也搭载了基于受体的设计模块,诸如分子对接,虚拟筛选等模块。

主要技术指标: Tripos公司推出的基于Linux操作系统平台的Sybyl6.5软件,其核心技术包括SYBYL base、Concord3、MOLCAD、Advanced Computation模块;药效团技术GASP、DISCO模块;QSAR技术CoMFA、CoMSIA模块;蛋白建模与结构预测Biopolymer模块;虚拟筛选与对接Surflex‐Dock模块;化学信息学UNITY base 、Concord Standalone模块。SYBYL提供多种分子模拟方法,例如药效团模型的构建、分子对接模型的构建、定量构效关系模型的构建。

安放地址: 望京中环南路6号

服务内容: 本系统基于SYBYL软件,可为分子模拟研究者提供包括结构搭建、优化、比较、结构与相关数据可视化、注解、硬拷贝、以及屏幕截图等综合的分子模拟工具。其主要包括的分子模拟模块有基于配体的设计,基于受体的设计,结构生物学,化学信息学等,具体为CoMFA、GASP、DISCO等,是进行分子模拟工作的优秀工具。

服务的典型成果: 本实验室使用CoMFA和CoMSIA模块开展了中药药效成分与色谱保留时间、药物活性等定量构性、构效关系研究;利用DISCO和GASP模块建立了降脂、老年痴呆相关靶标的药效团模型,并对中药活性化合物进行了筛选,获得的化合物具有潜在的进一步研究价值。

对外开放共享规定: 软件目前安装于中药学院科技发展部202实验室的服务器上,有专人负责管理,使用软件的相关记录既包括软件后台的记录,同时,使用人员也需要进行使用登记。该软件具有共享平台功能,可以预约使用。

参考收费标准: 校内20元每小时、校外30元每小时



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