2012年国家自然科学基金委员会（NSFC）与日本科学技术振兴机构（JST）将共同资助合作研究项目。经公开征集，根据我委有关规定并与JST核对申请项目清单，共有以下32项申请通过初审：
| 序号 | 科学部 编号 | 项目名称 | 申请人 依托单位 | 日方申请人 日方单位 | 类别 |
| 1 | 212111022 | 废水毒性控制方法与应用原理 | 全燮 大连理工大学 | Shigeki ASUNAGA 横滨国立大学 | 合作研究 |
| 2 | 212111015 | 全天候协同光催化降解染料污染物净化废水 | 李和兴 上海师范大学 | Hiromi AMASHITA 大阪大学 | 合作研究 |
| 3 | 212111018 | 基于新兴污染物生态风险控制的污水深度处理技术研究 | 管运涛 清华大学 | Hiroaki Tanaka 京都大学 | 合作研究 |
| 4 | 212111033 | 污泥资源回收及碳源高品质转化技术与原理 | 王慧 清华大学 | Fumitake NISHIMURA 京都大学 | 合作研究 |
| 5 | 212111035 | 中日典型湖泊富营养化遥感监测与对比分析 | 马荣华 中国科学院南京地理与湖泊研究所 | Bunkei Matsushita 筑波大学 | 合作研究 |
| 6 | 212111027 | 节能低碳与资源回收型生活污水处理新工艺基础研究 | 刘俊新 中国科学院生态环境研究中心 | Osamu Nishimura 东北大学 | 合作研究 |
| 7 | 212111036 | 再生污水的光电协同净化系统及生物毒性检测技术的开发 | 只金芳 中国科学院理化技术研究所 | Fujishima Akira 东京理科大学 | 合作研究 |
| 8 | 212111044 | 强化电氧化去除水中典型PPCPs类污染物的原理与方法 | 曲久辉 中国科学院生态环境研究中心 | Yutaka Sakakibara 早稻田大学 | 合作研究 |
| 9 | 212111046 | 放射性污染废水的环境行为及处理技术研究 | 赵璇 清华大学 | Chihiro Inoue 东北大学 | 合作研究 |
| 10 | 212111047 | 用于工业废水中重金属离子处理的新型复合吸附剂的研究 | 朱孔军 南京航空航天大学 | Kazumichi Yanagisawa 高知大学 | 合作研究 |
| 11 | 212111049 | 电化学氧化-磁性活性污泥联合技术处理印染废水研究 | 张延荣 华中科技大学 | Tokuo Shimizu 宇都宫大学 | 合作研究 |
| 12 | 212111029 | 利用无机离子交换体处理放射性铯污染水的基础研究 | 杨晓晶 北京师范大学 | Akinari SONODA 独立行政法人产业技术综合研究所 | 合作研究 |
| 13 | 212111048 | 放射性污染废水的处理技术研究 | 李笃中 复旦大学 | Tohru Kawamoto 日本产业技术综合研究院 | 合作研究 |
| 14 | 212111031 | 放射性污染废水处理用高效率多功能吸附剂的开发以及适用性评价 | 韦悦周 上海交通大学 | Mimura Hitoshi 东北大学 | 合作研究 |
| 15 | 212111025 | 针对新兴污染物（ECs）的节能型污水深度处理技术与原理 | 于水利 同济大学 | Takizawa Satoshi 东京大学 | 合作研究 |
| 16 | 212111039 | 纳秒脉冲等离子体处理难降解全氟辛磺酸工业废水的研究 | 张彭义 清华大学 | Douyan Wang 熊本大学 | 合作研究 |
| 17 | 212111042 | 具有光催化和磁性分离功能的放射性铯吸附剂的开发和机理研究 | 王军虎 中国科学院大连化学物理研究所 | Kiyoshi Nomura 东京大学 | 合作研究 |
| 18 | 212111050 | 焦化废水中高氨氮难降解有机物去除的固定化-生物滤池与固定化-膜生物反应器系统优化及其生物强化机理研究 | 倪晋仁 北京大学 | Hideto Matsuyama 神户大学 | 合作研究 |
| 19 | 212111021 | 电化学控制离子交换技术分离回收核废液中放射性离子 | 郝晓刚 太原理工大学 | Guoqing Guan 弘前大学 | 合作研究 |
| 20 | 212111026 | 基于资源回收及废水再利用的磁分离工业废水处理方法研究 | 李来风 中国科学院理化技术研究所 | Shigehiro Nishijima 大阪大学 | 合作研究 |
| 21 | 212111041 | 水环境中类雌激素生物标志物的筛选及其降解技术研究 | 张娴 中国科学院城市环境研究所 | Yingnan Yang 筑波大学 | 合作研究 |
| 22 | 212111020 | 太湖流域氮负荷定量评价及富营养化源头控制技术 | 赵由才 同济大学 | Tomochika Tokunaga 东京大学 | 合作研究 |
| 23 | 412111013 | 通过结晶过程高效清除放射性铯 | 杨跃涛 南京大学 | Yutaka Moritomo 筑波大学 | 合作研究 |
| 24 | 412111022 | 基于物理-生态动力学模型的近岸增养殖海域富营养化过程与机理研究 | 刘长发 大连海洋大学 | Yoshinori Miyamoto 东京海洋大学 | 合作研究 |
| 25 | 412111018 | 微生物强化下天然地质材料去除工业废水中砷的机理及应用 | 郭华明 中国地质大学(北京) | Zhenya Zhang 筑波大学 | 合作研究 |
| 26 | 412111017 | 一种用于富营养化湖泊修复和抑制蓝藻水华生长的分子生物学技术研究 | 田秉晖 中国科学院生态环境研究中心 | Kunio KOHATA 琦玉县环境科学国际中心 | 合作研究 |
| 27 | 412111020 | 溶解有机质在中日典型湖泊中归趋的对比研究 | 吴丰昌 中国环境科学研究院 | Shinichi Nakano 京都大学 | 合作研究 |
| 28 | 412111023 | 宁夏引黄灌区主排干沟水体富营养化防控技术研究 | 罗良国 中国农业科学院农业环境与可持续发展研究所 | Kaoru Abe 国立农业环境技术研究所 | 合作研究 |
| 29 | 412111024 | 利用地球化学工程学方法对工业废水和生活污水中全氟化合物的快速筛查和去除技术开发研究 | 杨永亮 国家地质实验测试中心 | Nobuyoshi Yamashita 日本产业技术综合研究院 | 合作研究 |
| 30 | 412111016 | 近海富营养化水体大型海藻利用与环境管理 | 杨宇峰 暨南大学 | Masanori Hiraoka 高知大学 | 合作研究 |
| 31 | 412111011 | 非点源污染与水体富营养化源头控制定量规划理论与技术 | 吕军 浙江大学 | Ryesuke Hatano 北海道大学 | 合作研究 |
| 32 | 412111015 | 贵州高原喀斯特深水水库富营养化生态过程及控制技术研究 | 李秋华 贵州师范大学 | Jun Nakajima 立命馆大学 | 合作研究 |
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